蛋白質(zhì)是組成人體一切細(xì)胞、組織的重要成分,但常言道,“過(guò)滿則虧,過(guò)猶不及”,機(jī)體內(nèi)蛋白質(zhì)過(guò)量可能會(huì)造成大問(wèn)題,比如增加患癌風(fēng)險(xiǎn),以及讓人們“老”得更快。
當(dāng)?shù)貢r(shí)間7月28日,頂級(jí)期刊《Nature》發(fā)布了一篇題為Rewiring of the ubiquitinated proteome determines ageing in C. elegans 的研究報(bào)告,揭示了蛋白質(zhì)過(guò)度積聚與壽命之間的關(guān)聯(lián)。
德國(guó)科隆大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),那些更短壽的秀麗隱桿線蟲(chóng),隨著年齡的增長(zhǎng)往往面臨著蛋白質(zhì)清除功能障礙問(wèn)題,導(dǎo)致體內(nèi)蛋白質(zhì)的沉積,而如果通過(guò)基因治療或化學(xué)藥物加快蛋白質(zhì)的分解,或可幫助線蟲(chóng)延長(zhǎng)1/5的壽命。

doi.org/10.1038/s41586-021-03781-z
真核細(xì)胞內(nèi)有數(shù)萬(wàn)種行使各種功能的蛋白質(zhì),其中內(nèi)源性蛋白質(zhì)都有一定的壽命,“到點(diǎn)了”便會(huì)被降解。泛素化(Ub)便是引導(dǎo)蛋白質(zhì)降解的途徑之一,能夠給不同類別的蛋白質(zhì)打上“標(biāo)簽”,使其被細(xì)胞內(nèi)相應(yīng)的酶識(shí)別并降解。當(dāng)然,該過(guò)程是可逆的,能夠被去泛素化酶(DUBs)逆轉(zhuǎn)。
盡管泛素化參與幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控,但是目前人們?nèi)圆磺宄撨^(guò)程對(duì)衰老的影響。因此,研究人員從秀麗隱桿線蟲(chóng)著手,嘗試探索泛素化與衰老間的潛在關(guān)聯(lián)。
通過(guò)將年輕線蟲(chóng)(誕生5天)與老年線蟲(chóng)(誕生15天)進(jìn)行比較,研究人員發(fā)現(xiàn),老年線蟲(chóng)的泛素化普遍減少,并且有350 個(gè) Ub 肽被上調(diào),1,813個(gè)Ub 肽被下調(diào),這為衰老與泛素化過(guò)程存在關(guān)聯(lián)提供了證據(jù)。

Ub 蛋白質(zhì)組隨年齡增長(zhǎng)的重構(gòu)
為了進(jìn)一步評(píng)估泛素化的年齡相關(guān)變化,研究人員進(jìn)行了蛋白質(zhì)印跡分析,結(jié)果顯示,與年輕或長(zhǎng)壽線蟲(chóng)相比,老年野生型線蟲(chóng)表達(dá)更高甚至相當(dāng)?shù)姆核鼐幋a基因,說(shuō)明泛素化的減少并不是由于泛素表達(dá)的較少或轉(zhuǎn)換率的變化而造成的。
這就很有意思了,難道有一股“神秘力量”,在影響蛋白質(zhì)的泛素化過(guò)程?在進(jìn)一步分析中,研究人員終于找到了導(dǎo)致泛素化減少的因素--去泛素化酶(DUB)。在老年野生型線蟲(chóng)體內(nèi),DUB表達(dá)水平顯著上調(diào),而使用廣譜 DUB 抑制劑 PR-619處理足以挽救低泛素化水平并延長(zhǎng)蠕蟲(chóng)壽命。

抑制DUB挽救了了泛素化過(guò)程
盡管蛋白質(zhì)豐度和泛素化水平之間似乎沒(méi)有直接的相關(guān)性,但研究人員發(fā)現(xiàn)192 種泛素化程度較低的蛋白質(zhì)在老年線蟲(chóng)體內(nèi)積聚,并且這種積累是由于下降的泛素化水平阻礙了蛋白酶體對(duì)蛋白質(zhì)的識(shí)別和降解。
經(jīng)過(guò)基因工程改造,研究人員找到了10個(gè)年齡相關(guān)的失調(diào)蛋白酶體靶點(diǎn),分別是IFB-2、EPS-8、RPL-4、M01G12.9、C46C2.2、F54D1.6、DDI-1、LEC-1、HSP-43 和 USP-5。其中,HSP-43 和 USP-5是細(xì)胞活力的重要基因,敲除這兩個(gè)基因?qū)е铝巳湎x(chóng)壽命的縮短,而另外8個(gè)基因的敲除則足以延長(zhǎng)蠕蟲(chóng)的壽命。
值得注意的是,IFB-2、EPS-8的敲除對(duì)壽命的影響較大,并且單個(gè)基因的敲除或可幫助線蟲(chóng)延長(zhǎng)21%的壽命。IFB-2僅在腸細(xì)胞中特異性表達(dá),該基因的增加可能導(dǎo)致了腸道完整性的喪失;作為細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路底物,EPS-8表達(dá)的增加會(huì)過(guò)度激活RAC通路,造成肌動(dòng)蛋白過(guò)度重塑和聚合,從而影響有機(jī)體的壽命、肌肉功能和活動(dòng)能力。

與年齡相關(guān)的去泛素化破壞了長(zhǎng)壽調(diào)節(jié)劑的靶向降解
該研究的領(lǐng)導(dǎo)者、德國(guó)科隆大學(xué)分子醫(yī)學(xué)中心的David Vilchez說(shuō):“我們的研究結(jié)果帶來(lái)了潛在的延緩衰老和提高老年生活質(zhì)量的新方法,尤其是在衰老與泛素修飾蛋白間建立起了聯(lián)系,這將為今后其他研究人員關(guān)于衰老、泛素化和其他細(xì)胞過(guò)程的研究帶來(lái)重大影響。”

蠕蟲(chóng)的蛋白質(zhì)清除功能障礙導(dǎo)致組織功能下降
當(dāng)然,仍然存在一些問(wèn)題有待解決,比如導(dǎo)致DUB隨年齡增加的機(jī)制是什么,在小鼠、靈長(zhǎng)類動(dòng)物等更為復(fù)雜的生物中是否也能觀察到泛素化隨年齡增長(zhǎng)的這種變化。但總體而言,這項(xiàng)研究揭示了衰老過(guò)程中,組織內(nèi)整體去泛素化會(huì)影響蛋白質(zhì)的降解從而損害壽命,并揭示了IFB-2、EPS-8是兩個(gè)較為突出的抗衰靶標(biāo)。